Wanneer een bedrijf na de hercontrole niet voldoet aan de milieuwet- en regelgeving, dan vindt het opleggen van een dwangsom of het toepassen van bestuursdwang plaats.
Het betreffende bedrijf krijgt meestal een termijn waarin de overtredingen kunnen worden opgeheven. Bij acuut gevaar voor het milieu wordt echter gelijk een sanctie opgelegd. Na de hersteltermijn wordt het bedrijf opnieuw gecontroleerd. Zijn de overtredingen niet in orde? Dan wordt de sanctie uitgevoerd. Deze sanctie blijft van kracht totdat de overtreding door het bedrijf ongedaan is gemaakt.